蘇州大學附屬兒童醫院創建于1959年，由國內著名兒科陳務民、彭大恩、何馥貞等在原蘇州醫學院附屬醫院兒科基礎上獨立組建，隸屬于江蘇省衛生和計劃生育委員會，是一所集醫教研防為一體的前幾名兒童專科醫院。
經過50余年的發展，蘇州大學附屬兒童醫院擁有總院和景德路兩個院區。總院位于美麗的金雞湖東畔，占地面積近6萬平方米，一期工程建筑面積13.3萬平方米，已于2015年6月1日正式啟用。景德路院區位于姑蘇古城中心區域，環抱遂園，占地面積1.8萬平方米，建筑面積4.5萬平方米。醫院現有職工近1700余名，開放床位1158張。
醫院作為江蘇省兒科類緊急醫學救援基地，江蘇省首批“新生兒危急重癥救治指導中心”，蘇州市危重新生兒救治中心，市新生兒急救分站，市兒童創傷救治中心建設單位。全面承擔了蘇州及周邊地區急、危、重、疑難兒童的救治任務，為江蘇省、蘇州市兒童緩解保健事業的發展作出了重要貢獻。2017年全院完成門急診總量近215.1萬人次，出院病人5.1萬余人次，手術近1.49萬人次。
經過多年發展，醫院科室設置齊全，專科發展迅速。現擁有26個臨床專業科室，6個醫技科室，涵蓋兒科諸領域。血液內科、新生兒科、小兒骨科、小兒普外科、小兒腎臟內科、小兒神經內科、小兒心血管內科、小兒呼吸內科、小兒傳染科、小兒內分泌科、小兒泌尿外科、急診醫學科為江蘇省臨床重點專科，醫學檢驗科為江蘇省臨床重點專科建設單位，檢驗科、小兒消化內科、藥劑科為蘇州市臨床重點專科，神經外科為蘇州市臨床重點專科建設單位。
以蘇州大學兒科臨床醫學院為依托，醫院全面推動教學設置與方法的改革和創立。目前醫院是兒科學博士點、碩士點，急救醫學碩士點，擁有研究生導師64名，其中博士生導師19名。每年承擔本科、研究生以及海外學生的教學任務，年招收博士研究生19名，碩士研究生74名。作為兒科、兒外科、麻醉、放射、超聲住院醫師規范化培訓基地，承擔蘇州大市范圍內兒科醫師的集中規范化培訓，優先引入美國心臟協會（AHA）生命支持系列國際認證課程，年招收規培醫師近140名(含四證合一)。醫院作為“蘇州市兒科進修學院”項目的實施單位，成功舉辦蘇州市兒科進修學院屆進修班，在蘇州園區范圍內共招收25名學員并順利結業。
醫院堅持“科教強院”的發展戰略和構建研究型醫院的發展目標。兒科學為“十三五”江蘇省醫學重點學科（A類），新生兒醫學、兒童心臟病一體化診療中心是江蘇省婦幼健康重點學科。依托醫院建有蘇州市小兒內科臨床醫學中心、蘇州市小兒準確外科臨床醫學中心（建設項目）；小兒呼吸科學、小兒心血管病學和感染性學是蘇州市醫學重點學科。擁有蘇州大學兒科臨床研究院、江蘇省衛生計生委轉化醫學基地及蘇州市重點實驗室6個（兒童發育腦損傷防治研究重點實驗室、兒科轉化醫學重點實驗室、兒童心臟及血管重點實驗室、兒童腎臟病重點實驗室、兒童白血病重點實驗室及兒童呼吸病重點實驗室）。近五年來,醫院累計承擔、省部及市廳等各級各類縱向課題360余項，其中自然科學基金項目、公益性行業科研專項等重要課題66項；獲省部、市科技進步獎及省、市醫學新技術引進獎112項；發表科技論文1300余篇，其中SCI論文258篇；獲得授權專利60余項、計算機軟件著作權2項。舉辦、省級繼續醫學教育項目近80項。
在人才重點培養、儲備、引進以及人才梯隊的建設方面，醫院逐步培養了一支兼具醫、教、研綜合能力和創立意識的出眾人才隊伍。近五年來有省“科教興衛工程”醫學領軍人才與創立團隊1個， 省特聘醫學2名、特聘教授1名，省醫學重點人才4名，省衛生領軍人才1名、衛生出眾人才6名，省“333工程”培養對象7名，省“雙創博士”1名，省“雙創人才”1名；市姑蘇“領軍人才”2名；市姑蘇“重點人才”7名。
醫院秉承“博學、求精、協進、仁愛、感恩”的院訓，堅持“關愛兒童、呵護生命”的服務宗旨，被設為“殘疾孤兒手術康復明天計劃”江蘇省定點醫院。同時醫院以創建好的醫院為契機，在強化內涵的同時，拓展延伸服務，被評為2015-2017年全國改善緩解服務先進典型——構建和諧關系示范醫院，省、市文明單位，“平安醫院”、“實施患者目標合格醫院”。醫院“無假日”“夜間”門診特色服務、“千名醫生走基層”被評為蘇州市衛生行業文明服務品牌，“小丁青年志愿者營”公益志愿活動深受社會歡迎。
